Er is een betekenisverschil.

 

zusterschool

een school die de 'zuster' is van een andere school
De uitmuntende student ging een semester aan een zusterschool in het buitenland studeren.

 

zustersschool

een school waar zusters lesgeven
Mijn zusje kan uren vertellen over haar belevenissen vroeger als kind op de zustersschool.

 

Het onderscheid moet u niet al te ver doorvoeren. Dus in een tekst over nonnen die een school runnen en van daaruit filialen oprichten moet u niet spreken over zustersscholen en zusterscholen. Dan wilt u wel heel veel met die ene tussen-s.

 

Kijk voor andere voorbeelden van (mogelijk) betekenisverschil in samenstellingen met een tussen-s bij beheersysteem / beheerssysteem.